La plate-forme suit et supervise la réalisation de projets nécessitant l’approche de la biocristallographie. Il s’agit en particulier :
Diffractomètre à microfoyer équipe d'un goniomêtre quatre-cercles et d'un detecteur bi-dimensionnel CCD.
Installation de cryogénie pour collecte des données de diffraction à basse température et conservation de cristaux congelés.
Robots de cristallisation de dispense de nano-gouttes ( modèle Honeybee, Protein Solutions).
Équipements de cristallogenèse : chambres de cristallisation à 18°C et 4°C.
1 cluster de calcul 6 processeurs sous Linux; environnement interconnecté de 6 PC (dont 5 sous linux) servant à la visualisation et à la manipulation de modèles et au traitement des données. Support logiciel associé comprenant des chaînes de programmes de biologie structurale et biocristallographie (construction interactive de modèles, graphisme et modélisation moléculaires, dynamique moléculaire, analyse des relations structure/fonction).
Il existe 3 types d’accès aux services d’EMBRC France :
l’accueil scientifique, l’accueil pédagogique, l’accès à distance.
Merci de remplir votre panier en sélectionnant le type d'accès qui correspond à votre demande. Sur les prestations ci-dessous seuls les types d'accès proposés pour la prestation sont indiqués et peuvent être ajoutés à votre panier.
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Nos sites :
- Tout -
Banyuls-sur-Mer
Roscoff
Villefranche-sur-Mer
Prestation :
Tests de cristallisation
Services :
Sites :
Nous offrons la possibilité de tester plus de 500 conditions de cristallisations, grâce à l'utilisation d'un robot de dispense de nano-gouttes (Crystal Gryphon) avec un grand choix de kits de criblage commerciaux (principalement la série Nextal de Quiagen). Ces tests de cristallisation peuvent être réalisés en présence de ligands ou d'additifs (par exemple des détergents). La technique utilisée pour ces essais est la méthode de la goutte assise qui nécessite au minimum 0.5 microL de solution protéique par plaque de 96 conditions. Si ces premiers tests aboutissent à des (micro-)cristaux, des criblages autour des conditions de cristallogenèse pourront être effectués afin d'améliorer la qualité et la taille de des cristaux.
Prestation :
Diffraction, détermination des structures 3D et affinement
Services :
Sites :
Si les essais de cristallogenèse aboutissent à l'obtention de cristaux ayant un pouvoir diffractant d'au moins 3 Angstrœm au synchrotron (ESRF à Grenoble), la détermination de la structure sera entamée. Dans le cas ou l'analyse bio-informatique révèlerait des homologues structuraux de la protéine cristallisée, la résolution de la structure sera effectuée par remplacement moléculaire. Dans le cas contraire, des dérivés d'atomes lourds pourront être préparés (séléno-méthionine, séléno-cystéine, ...), afin d'utiliser les différentes méthodes de remplacement isomorphes .