La Plateforme d’Imagerie par Microscopie de Villefranche-sur-Mer (PIM) rassemble les systèmes de microscopie de la station marine de Villefranche depuis 1988 ayant comme domaine principal de compétences l’imagerie des organismes marins vivants (méduses, ascidies, oursins, etc…). Elle est ouverte à l’ensemble des structures publiques et privées sans aucune condition thématique, institutionnelle ou géographique.
Actuellement, la PIM est une plateforme de l’institut de la Mer de Villefranche/Mer, elle met au service de ses utilisateurs des microscopes optiques performants (confocaux, épifluorescences motorisés et lightsheet) et un microscope électronique à balayage. Afin d’être adaptées à l’imagerie des organismes marins vivants, l’ensemble des microscopes optiques sont régulés à une température d’environ 18°C.
La plateforme propose différents services regroupé en 3 catégories :
La plateforme forme et rend autonome les utilisateurs sur différents type de microscopes.
Pour des projets spécifiques, un ingénieur de la plateforme peut être impliqué pour 3 types de projets:
Le service de stockage et de data management (OMERO) propose un outil cadrant les processus de gestion, de traitement, de partage et de stockage des images de microscopie. La base de données OMERO qui a été mise en place en partenariat avec l'Institut Français de BioInformatique et France-BioImaging, donne un accès aux ressources de façon complètement délocalisée. Ce projet a été mutualisé avec la communauté en sciences de la vie de l'Université Côte d'Azur.
La prestation comprend l’apprentissage à l’utilisation d’OMERO et un espace alloué pour un utilisateur ou une équipe.
La page de la plateforme PIM :
https://lbdv.imev-mer.fr/accueil-fr/recherche/services-a-la-recherche/imagerie/
La page de la plateforme MICA, labellisée IBiSA dont fait partie la PIM :
https://univ-cotedazur.fr/mica
Confocal Leica Stellaris 5 ou Leica SP8
Sites :
Zeiss Observer ou Nikon TiE2 ou Axiovert A1
Sites :
Leica Viventis LS2
Sites :
Sites :
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