Plateforme de Biologie Moléculaire - Service Cytométrie
La plateforme de Biologie Moléculaire (PBM), labellisée EMBRC (European Marine Biology Ressources Centre) en 2022, assure des prestations de biologie moléculaire: pour évaluer la qualité et quantité des acides nucléiques, effectuer l’amplification de l’ADN en temps réel, analyser de microplaques, génotypage par PCR, clonage dans plasmides.
Rattachée à la Plateforme de biologie moléculaire (PBM) de l'Institut de recherche marine de Villefranche (IMEV), notre service de cytométrie en flux permet l'étude des particules en suspension (biotiques ou abiotiques) à l'échelle de la cellule individuelle. L’identification des différents groupes fonctionnels — virus, bactéries, phytoplancton, flagellés hétérotrophes — est réalisée en mesurant la fluorescence de chaque cellule et la diffusion lumineuse (FSC et SSC), indicateurs de taille et de complexité cellulaire. Les cellules sont soit marquées par des fluorophores (ex. : bactéries hétérotrophes), soit détectées par autofluorescence (ex. : organismes photosynthétiques). Les applications principales concernent la structure des communautés microbiennes planctoniques (marines ou d'eau douce) et les cultures cellulaires.
Services Proposés au sein de la PBM :
Sites :
Services Proposés en cytométrie :
Le tri cellulaire activé par fluorescence (FACS) est une application spécialisée de la cytométrie de flux. Cette technique permet de séparer, cellule par cellule, un mélange hétérogène en fonction de leurs propriétés individuelles de diffusion de la lumière et de fluorescence. Plusieurs populations cellulaires d’intérêt peuvent être isolées simultanément grâce aux différentes voies de tri disponibles. Selon le niveau de pureté souhaité, différents modes de tri peuvent être utilisés. Le mode Single Cell, en particulier, permet d’isoler une cellule unique par puits, notamment dans des microplaques de 96 puits.
Sites :
L'instrument Aurora CS est un cytomètre spectral qui a la capacité de mesurer l’ensemble des spectres d’émission des fluorochromes ou des sondes fluorescentes excités par l’ensemble des lasers installés sur l’instrument. Notre Aurora est équipé de trois lasers (Violet/405, Bleu/488 et Rouge/640 nm de longueur d’onde d’excitation), de trois canaux de diffusion (FSC et SSC sur les lasers bleu et violet) et de 38 canaux de fluorescence.
Sites :
Notre CytoFLEX S est un cytomètre en flux conventionnel équipé de trois lasers d’excitation (Violet /405 , Bleu/488 et Jaune‑vert/561 nm de longueur d'onde d'excitation). Il dispose de trois canaux de diffusion (FSC et SSC sur les lasers bleu et violet) ainsi que de six canaux de fluorescence, soit deux détecteurs par laser. L’instrument est doté de 13 filtres band‑pass repositionnables, permettant d’adapter facilement la configuration optique en fonction des besoins expérimentaux. Un chargeur de plaques 96 puits est intégré, offrant la possibilité de réaliser des acquisitions automatiques à plus haut débit. Grâce à sa grande sensibilité, le CytoFLEX S permet également le comptage absolu de particules, ce qui le rend particulièrement polyvalent pour de nombreuses applications en cytométrie.
Sites :
